Kerkenes'de arkeolojik araştırmalar (Şek. 7 ve 8) önceki yıllarda olduğu gibi jeofizik yüzey araştırmasına adanmış bahar dönemi ve kazı ile kazı evi deposunda bulunan bu ve geçmiş yıllara ait buluntular üzerinde çalışılan ana dönemden oluşan iki bölüme ayrılmıştır. Kazı çalışmalarının odak noktası Anıtsal Giriş'in tamamının ortaya çıkarılmasını sağlayan "Saray Yapı Grubu" olmuştur (Şek. 9). İki büyük kule arasındaki alanın ön tarafında uzanan taş döşeme tamamen ortaya çıkarılmış ve iç geçit ön ve yan yüzleri kısmen açığa çıkacak şekilde kazılmıştır. Bu çalışma kazı programının başarılı bir şekilde tamamlanmasını ve 2006 sezonu için yayın çalışmaları ve buluntuların incelenmesi üzerine yoğunlaşılmasını sağlamıştır. Kapadokya Kapısı'ndaki sınırlı çalışma, görsel açıdan çok etkileyici olan bu anıtı daha güvenli ve dikkat çekici hale getirirken, geçit yan duvarının altının zayıflamasına neden olan erozyona da engel olmuştur. Bu alan için üç yıllık bir konservasyon ve restorasyon projesi planlanmaktadır.